A medida que fue pasando el tiempo necesitó de diversas ampliaciones que fueron llevadas a cabo por diversos arquitectos como Phillip Johnson y James Fanning.

Pero sin duda, desde el punto de vista arquitectónico, la reforma más sorprende de este museo fue llevada a cabo en el año 2004 por el arquitecto japonés Yoshio Taniguchi, que dotó con su imaginación al MOMA de espacios comunicados por más de una zona y de una amplitud visual extraordinaria.

Por ello es que al  visitarlo se tiene la sensación  de fluir entre salas minimalistas dejando toda la importancia a la espectaculares obras que alberga.

La reforma consistió en una ampliación adquiriendo un hotel que fue derribado y remodelado de forma que se integrara perfectamente con el estilo del edificio principal, y duplicando su espacio. Al ser un museo privado, fue bastante difícil encontrar la financiación necesaria, que ascendió finalmente a más de ochocientos millones de euros.

Dado el carácter tan humilde de Yoshio Taniguchi, nadie imaginó, ni por un momento, que supiera aprovechar parte de los antiguos elementos del museo e integrarlos en su proyecto de una forma tan arriesgada, y efectiva, como fue el rescatar la antigua Torre del Museo y hacerla el enclave por excelencia del Jardín de las Esculturas diseñado por Phillip Johnson.

Hay rumores de que existe un futuro proyecto de ampliación, que de llevarse a cabo, contará para su diseño con el acreditado arquitecto Jean Nouvel.